Файловая структура Bitrix Framework

позволяет исключить возможность изменения публичной части сайта при загрузке обновлений продукта
позволяет не подключать БД там, где это не нужно
организована таким образом, что программные компоненты ядра продукта были отделены от пользовательских файлов, а также файлов, определяющих внешнее представление сайта
позволяет настроить внешний вид сайта практически под любую вашу задачу
обладает большей гибкостью за счёт того, что файл может быть исполняемым, а не просто местом хранения информации